Η λέξη ποντίκι προέρχεται από τη λέξη πόντος, που σημαίνει θάλασσα. Τα εν λόγω τρωκτικά, επειδή προέρχονταν κυρίως από τον Εύξεινο Πόντο, μέσω των φορτηγών πλοίων που μετέφεραν τρόφιμα, πήραν τον προσδιορισμό ποντικός, ποντικός μῦς (ποντίκι από τον Πόντο, την Μαύρη Θάλασσα).
Με τα χρόνια έμεινε μόνο ο προσδιορισμός ποντικός, ο οποίος προσδιορίζει ολόκληρη την κατηγορία των συγκεκριμένων τρωκτικών.
ποντίκι < μεσαιωνική ελληνική ποντίκιον < υποκοριστικό του ποντικός
< ποντικός μῦς (ποντίκι από τον Πόντο, την Μαύρη Θάλασσα).
